ANALISIS IN-SILICO PENGHAMBATAN MAIN PROTEASE (MPRO) PADA SARS-CoV-2 OLEH SENYAWA AKTIF TEH HIJAU (Camelia sinensis)

Rosario Trijuliamos Manalu; Harfiana Safitri; Hesti Paramita Sari; Rheamanda Devina; Irnawati Irnawati; Eni Asmarizah Liliwana

doi:10.47653/farm.v8i2.548

ANALISIS IN-SILICO PENGHAMBATAN MAIN PROTEASE (MPRO) PADA SARS-CoV-2 OLEH SENYAWA AKTIF TEH HIJAU (Camelia sinensis)

Rosario Trijuliamos Manalu, Harfiana Safitri, Hesti Paramita Sari, Rheamanda Devina, Irnawati Irnawati, Eni Asmarizah Liliwana

Sari

COVID-19 adalah penyakit pernapasan akibat virus yang menyebabkan keadaan darurat kesehatan global dan diumumkan sebagai penyakit pandemi oleh Organisasi Kesehatan Dunia. Kurangnya molekul obat tertentu atau strategi pengobatan untuk melawan penyakit ini membuatnya semakin parah. Oleh karena itu, molekul obat yang efektif sangat dibutuhkan untuk melawan COVID-19. Protease utama (Mpro) dari SARS CoV 2, komponen kunci dari replikasi virus ini, dianggap sebagai target utama pengembangan obat anti-COVID-19. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui apakah senyawa yang ada di dalam tumbuhan Camellia sinensis berpotensi sebagai obat COVID-19. Jenis penelitian adalah in silico menggunakan metode molecular docking. Hasil studi ini menunjukkan bahwa dari 8 senyawa aktif, CG (Catechin gallat) dan ECG (Epicatechin gallate) menunjukkan potensi untuk diteliti lebih lanjut, karena potensi aktivitasnya lebih kuat dibandingkan dengan senyawa pembanding Remdesivir, dengan score masing-masing -111,407 dan -111.391. Selain itu juga melakukan visualisasi residu setiap senyawa yang ada pada tumbuhan Camellia sinensis dengan Reseptor SARS-CoV-2 menggunakan Webserver PLIP. Sebanyak 5 senyawa aktif dari tanaman Camellia sinensis disaring melalui penapisan berdasarkan parameter Lipinskiâ€™s Rule of Five dan prediksi ADMET menggunakan pkCSM. Potensi inhibisi SARS-CoV-2 oleh Catechin gallat dan Epicatechin gallat dari penelitian ini dapat menjadi titik awal dalam proses pengembangan obat terapi COVID-19 dari senyawa bahan alam.

Kata Kunci

In-Silico, Main Protease, Teh Hijau, SARS-CoV-2

Teks Lengkap:

PDF (English)

Referensi

Ai, Z., Liu, S., Qu, F., Zhang, H., Chen, Y., & Ni, D. 2019. molecules Effect of Stereochemical Configuration on the Transport and Metabolism of Catechins from Green Tea across Caco-2 Monolayers. https://doi.org/10.3390/molecules24061185

Carneiro, B. M., Batista, M. N., Braga, A. C. S., Nogueira, M. L., & Rahal, P. 2016. The green tea molecule EGCG inhibits Zika virus entry. Virology, 496. https://doi.org/10.1016/j.virol.2016.06.012

Ferwadi, S., Gunawan, R., & Astuti, W. 2017. Studi Docking Molekular Senyawa Asam Sinamat Dan Derivatnya Sebagai Inhibitor Protein 1J4X Pada Sel Kanker Serviks. Jurnal Kimia Mulawarman, 14(2).

Fitriansyah, N. S., Wirya, S., & Hermayanti, C. 2016. Formulasi Dan Evaluasi Spray Gel Fraksi Etil Asetat Pucuk Daun Teh Hijau (Camelia Sinensis [L.] Kuntze) Sebagai Antijerawat. Pharmacy, 12(02).

Gorbalenya, A. E., Baker, S. C., Baric, R. S., de Groot, R. J., Drosten, C., Gulyaeva, A. A., Haagmans, B. L., Lauber, C., Leontovich, A. M., Neuman, B. W., Penzar, D., Perlman, S., M Poon, L. L., Samborskiy, D. V, Sidorov, I. A., Sola, I., & Ziebuhr, J. (n.d.). 2020. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nature Microbiology. https://doi.org/10.1038/s41564-020-0695-z

Huang, C., Wang, Y., Li, X., Ren, L., Zhao, J., Hu, Y., Zhang, L., Fan, G., Xu, J., Gu, X., Cheng, Z., Yu, T., Xia, J., Wei, Y., Wu, W., Xie, X., Yin, W., Li, H., Liu, M., â€¦ Cao, B. 2020. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet, 395(10223), 497â€“506. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5

Kartasasmita, R. E., Herowati, R., Harmastuti, N., & Gusdinar, T. 2010. Quercetin Derivatives Docking Based On Study Of Flavonoids Interaction To Cyclooxygenase-2. Indonesian Journal of Chemistry, 9(2). https://doi.org/10.22146/ijc.21545

Koech, R. K., Wanyoko, J., & Wachira, F. (2014). Antioxidant, antimicrobial and synergistic activities of tea polyphenols. International Journal of Infectious Diseases, 21. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2014.03.631

Kusmita, L., Puspitaningrum, I., & Limantara, L. 2015. Identification, Isolation and Antioxidant Activity of Pheophytin from Green Tea (Camellia Sinensis (L.) Kuntze). Procedia Chemistry, 14. https://doi.org/10.1016/j.proche.2015.03.033

Lipinski, C. A. 2004. Lead- and drug-like compounds: The rule-of-five revolution. In Drug Discovery Today: Technologies (Vol. 1, Issue 4, pp. 337â€“341). Elsevier. https://doi.org/10.1016/j.ddtec.2004.11.007

Lipinski, C. A., Lombardo, F., Dominy, B. W., & Feeney, P. J. 1997. Experimental and computational approaches to estimate solubility and permeability in drug discovery and development settings. In Advanced Drug Delivery Reviews (Vol. 23, Issues 1â€“3, pp. 3â€“25). Elsevier Science B.V. https://doi.org/10.1016/S0169-409X(96)00423-1

Manalu, R. T., Meheda, I. O., & Octaviani, C. 2021. Penghambatan Aktivitas HMG-CoA Reductase dari Senyawa Aktif Jahe (Zingiber officinale): Studi In-Silico Inhibition of HMG-CoA Reductase Activity from Active Compounds of Ginger (Zingiber officinale): In-Silico Study. 32â€“38.

Naik, V. R., Munikumar, M., Ramakrishna, U., Srujana, M., Goudar, G., Naresh, P., Naveen Kumar, B., & Hemalatha, R. 2020. Remdesivir (GS-5734) as a therapeutic option of 2019-nCOV main protease-in silico approach. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. https://doi.org/10.1080/07391102.2020.1781694

Rachmania, R. A., Hariyanti, H., Zikriah, R., & Sultan, A. 2018. Studi In Silico Senyawa Alkaloid Herba Bakung Putih (Crinum Asiaticum L.) pada Penghambatan Enzim Siklooksigenase (COX). Jurnal Kimia VALENSI, 4(2). https://doi.org/10.15408/jkv.v4i2.7686

Rothan, H. A., & Byrareddy, S. N. 2020. The epidemiology and pathogenesis of coronavirus disease (COVID-19) outbreak. In Journal of Autoimmunity (Vol. 109, p. 102433). Academic Press. https://doi.org/10.1016/j.jaut.2020.102433

Usman Sumo Friend Tambunan. 2012. In silico design of cyclic peptides as influenza virus, a subtype H1N1 neuraminidase inhibitor. African Journal Of Biotechnology, 11(52). https://doi.org/10.5897/ajb11.4094

DOI: http://dx.doi.org/10.47653/farm.v8i2.548

Refbacks

Saat ini tidak ada refbacks.

Jurnal Farmagazine is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.

Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat (LPPM)

Alamat Redaksi: Jln. KH Syekh Nawawi (Raya Pemda) KM. No. 4, Mata Gara, Kec. Tigaraksa, Tangerang, Banten 15720

Email: lppm@stfm.ac.id

Indexed By

	All	Since 2016
Citation	103	103
h-Index	4	4
i-Index	2	2

Nama Pengguna
Kata Sandi
Ingat Saya